Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm6594J3QM43 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm6594J3QM43 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm6594J3QM43 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6594J3QM43 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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