Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm20828J3KMI7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm20828J3KMI7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm20828J3KMI7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm20828J3KMI7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm20828J3KMI7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm20828J3KMI7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm20828J3KMI7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm20828J3KMI7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm20828J3KMI7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm20828J3KMI7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm20828J3KMI7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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