Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20815J3KMI0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms