Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn20G5E8X0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Cldn20G5E8X0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Cldn20G5E8X0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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