Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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H2-M1F7CXU4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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H2-M1F7CXU4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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H2-M1F7CXU4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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H2-M1F7CXU4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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H2-M1F7CXU4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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H2-M1F7CXU4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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H2-M1F7CXU4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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H2-M1F7CXU4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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H2-M1F7CXU4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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H2-M1F7CXU4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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