Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm28038F7BCN9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm28038F7BCN9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm28038F7BCN9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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