Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Unc93a-201ENSMUST00000084966 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pnisr-203ENSMUST00000108229 2922 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 9630001P10Rik-202ENSMUST00000181335 3006 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm28800-201ENSMUST00000186230 2243 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Dclre1b-201ENSMUST00000029435 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm10824-201ENSMUST00000220000 2198 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms