Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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