Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms