Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms