Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4E9QAP7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms