Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Urb2E9Q7L1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms