Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms