Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms