Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gcn1E9PVA8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gcn1E9PVA8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Gcn1E9PVA8 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gcn1E9PVA8 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gcn1E9PVA8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms