Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kif28pD3YXS5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kif28pD3YXS5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms