Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms