Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud7bB2RUR8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud7bB2RUR8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms