Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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