Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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