Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms