Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms