Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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