Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atp8b5A3FIN4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atp8b5A3FIN4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atp8b5A3FIN4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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