Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rnf39A2RT81 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rnf39A2RT81 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rnf39A2RT81 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf39A2RT81 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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