Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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