Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SetxA2AKX3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms