Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34dA2AGU5 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn34dA2AGU5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn34dA2AGU5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34dA2AGU5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms