Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms