Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm16A2A935 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm16A2A935 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm16A2A935 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm16A2A935 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm16A2A935 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Prdm16A2A935 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm16A2A935 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm16A2A935 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm16A2A935 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm16A2A935 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm16A2A935 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm16A2A935 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm16A2A935 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prdm16A2A935 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
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Prdm16A2A935 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
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Prdm16A2A935 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
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Prdm16A2A935 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Prdm16A2A935 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Prdm16A2A935 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Prdm16A2A935 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Prdm16A2A935 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Prdm16A2A935 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm16A2A935 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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