Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrit3W8DXL4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms