Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5114W4VSN8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm5114W4VSN8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5114W4VSN8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms