Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3550W4VSN7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3550W4VSN7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms