Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms