Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top3bQ9Z321 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top3bQ9Z321 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top3bQ9Z321 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms