Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Homer1Q9Z2Y3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Homer1Q9Z2Y3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms