Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms