Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubl3Q9Z2M6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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