Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crlf3Q9Z2L7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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