Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd4Q9Z2D7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd4Q9Z2D7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Mbd4Q9Z2D7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms