Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn8Q9Z260 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms