Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccne2Q9Z238 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccne2Q9Z238 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.3 ms