Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uso1Q9Z1Z0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms