Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms