Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clic1Q9Z1Q5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clic1Q9Z1Q5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Clic1Q9Z1Q5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clic1Q9Z1Q5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clic1Q9Z1Q5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clic1Q9Z1Q5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clic1Q9Z1Q5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clic1Q9Z1Q5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clic1Q9Z1Q5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clic1Q9Z1Q5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms