Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp4Q9Z1N6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfrp4Q9Z1N6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms