Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms