Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr4Q9Z1L2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr4Q9Z1L2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr4Q9Z1L2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr4Q9Z1L2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr4Q9Z1L2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr4Q9Z1L2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr4Q9Z1L2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms