Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sumo3Q9Z172 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sumo3Q9Z172 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sumo3Q9Z172 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sumo3Q9Z172 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms