Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ArcQ9WV31 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ArcQ9WV31 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms