Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU62

Incenp, Inner centromere protein, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IncenpQ9WU62 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IncenpQ9WU62 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
IncenpQ9WU62 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IncenpQ9WU62 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IncenpQ9WU62 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IncenpQ9WU62 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IncenpQ9WU62 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IncenpQ9WU62 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
IncenpQ9WU62 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IncenpQ9WU62 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms